Cepas chilenas de origen clínico de Vibrio cholerae no-O1, no-O139 portan los genes vcsN2, vcsC2, vcsV2, vspD, toxR2 y vopF del sistema de secreción T3SS2 presentes en una isla de patogenicidad / Chilean strains of clinical origin of non-O1, non-O139 Vibrio cholerae carry the genes vcsN2, vcsC2, vcsV2, vspD, toxR2 y vopF from secretion system T3SS2 present in an island of pathogenicity

Resumen Introducción. Los factores de virulencia de las cepas de Vibrio cholerae no-O1, no-O139 no son claramente conocidos. La cepa de origen septicémico NN1 Vibrio cholerae no-O1, no-O139 fue secuenciada previamente mediante la plataforma Illumina, detectándose en su genoma un fragmento de la isla de patogenicidad VPaI-7 de V. parahaemolyticus. Objetivo: detectar los genes de virulencia vcsN2, vcsC2, vcsV2, vspD, toxR2 y vopF en cepas chilenas clínicas de V. cholerae no-O1, no-O139. Material y Métodos: Un total de 9 cepas chilenas de origen clínico de Vibrio cholerae no-O1, no-O139 aisladas entre 2006-2012 fueron analizadas mediante ensayos de reacción de polimerasa en cadena (RPC, en inglés PCR) convencional para los genes de secreción tipo III codificados en dicha isla: vcsN2, vcsC2, vcsV2, vspD, toxR2 y vopF. Adicionalmente se determinó la presencia de los genes de virulencia hylA y rtxA. Además, se realizaron ensayos de repetitive element palindromic PCR (REP-PCR) y Enterobacterial repetitive intergenic consensus PCR (ERIC-PCR). Resultados: la mayoría (6/9) de las cepas chilenas de V. cholerae no-O1, no-O139 contiene todos los genes de secreción tipo III vcsN2, vcsC2, vcsV2, vspD, toxR2 y vopF, codificados en una isla de patogenicidad. Además, el total de las cepas (9/9) contiene los genes de virulencia hylA y rtxA. Conclusión: Estos resultados sugieren fuertemente la posibilidad que dichas cepas posean un potencial de virulencia importante en seres humanos.

Backgound: The virulence factors of the Vibrio cholerae non-O1, non-O139 strains are not clearly known. The strain of septicemic origin NN1 Vibrio cholerae non-O1, non-O139 was sequenced previously by the Illumina platform. A fragment of the pathogenicity island VPaI-7 of V. parahaemolyticus was detected in its genome. Aim: To detect the virulence genes vcsN2, vcsC2, vcsV2, vspD, toxR2 y vopF in Chilean strains of V. cholerae non-O1, non-O139. Methods: A total of 9 Chilean strains of clinical origin of Vibrio cholerae non-O1, non-O139 isolated between 2006-2012 were analyzed by conventional PCR assays for type III secretion genes encoded on that island: vcsN2, vcsC2, vcsV2, vspD, toxR2 and vopF. Additionally, the presence of the virulence genes hylA and rtxA was determined. In addition, REP-PCR and ERIC-PCR assays were performed. Results: most (6/9) Chilean V. cholerae non-O1, non-O139 strains contain the type III secretion genes vcsN2, vcsC2, vcsV2, vspD, toxR2 and vopF, encoded in an island of pathogenicity. In addition, all (9/9) the strains contain the virulence genes hylA and rtxA. Conclusion: These results strongly suggest the possibility that those strains possess an important virulence potential in humans.

Bacteriemias por Streptococcus gallolyticus (ex S. bovis) y su relación con patología colónica o hepatobiliar y endocarditis / Streptococcus gallolyticus (ex S. bovis) bacteremia and its relationship with colonic or hepatobiliary disease and endocarditis

Background: Bacteremia due to Streptococcus bovis (now S. gallolyticus) has been traditionally associated to colon or hepatobiliar disease and endocarditis but there is no information on this matter in Chile. Aims: To describe clinical features of adult patients suffering bacteremia by S. bovis/S. gallolyticus, identify the source of the bacteremia and the frequency of endocarditis. Methods: Retrospective-descriptive study using laboratory records. Results: Between January 2003 and August 2014, 23 S. bovis/S. gallolyticus bacteremic events were identified among 22 patients. Mean age was 72.7 years (range 46-96). Co-morbidities were frequent (9.1 to 47.6%). The primary source of bacteremia was intestinal in 52.2%; hepatobiliar in 17.4% and in 34.8% it was not elucidated. Six patients had infective endocarditis (26.1%) and one patient had espondylodiscitis (4.3%). S. bovis represented 39.1% of isolates (all until 2008), S. gallolyticus subsp pasteurianus 39.1% and, S. gallolyticus subsp infantarius and S. gallolyticus subsp gallolyticus 8.7% each one, respectively. Association studies between the bacteremic source or endocarditis with specific S. gallolyticus subspecies were limited by the small number of isolates. Seven patients (30.4%) underwent surgical interventions. In-hospital mortality reached 21.7% (n = 5). Conclusions: Although infrequent, bacteremic events by S. gallolyticus/S. bovis have increased in-hospital mortality, require surgical intervention and affect older patients with co-morbidities. Near two-thirds suffer from colonic or hepatobiliary disease that act as the primary source of bacteremia. In addition, near one fourth is affected by infective endocarditis. Detection of S. gallolyticus/S. bovis in blood cultures prompts a thorough clinical evaluation in order to clarify the source of the bloodstream infection and the presence of complications.

Antecedentes: Los cuadros de bacteriemia por Streptococcus bovis (actualmente S. gallolyticus) han sido tradicionalmente asociados a patología colónica o hepatobiliar y endocarditis pero no se conoce de estudios en Chile que hayan abordado este tema. Objetivos: Describir aspectos clínicos de pacientes adultos afectados por bacteriemias por S. bovis/S. gallolyticus, identificar la fuente de la bacteriemia y la frecuencia de endocarditis. Métodos: Diseño de tipo retrospectivo, descriptivo, con el registro de casos bacteriemia. Resultados: Entre enero de 2003 y agosto de 2014 se identificaron 23 eventos de bacteriemia por S. bovis/S. gallolyticus en 22 pacientes. La edad promedio fue de 72,7 años (rango 46-96). La prevalencia de diferentes co-morbilidades fue elevada (9,1 a 47,6%). El foco primario de la bacteriemia fue intestinal en 52,2%, hepatobiliar en 17,4% y, en 34,8% no se aclaró el foco. Seis pacientes presentaron endocarditis infecciosa (26,1%) y uno espondilodiscitis (4,3%). S. bovis representó 39,1% de los aislados (todos hasta el 2008), S. gallolyticus subsp pasteurianus 39,1%, S. gallolyticus subsp infantarius y S. gallolyticus subsp gallolyticus 8,7%, respectivamente. Los estudios de asociación estuvieron limitados por el bajo número de aislados. Siete pacientes (30,4%) debieron ser intervenidos quirúrgicamente. La mortalidad hospitalaria fue de 21,7% (n: 5). Conclusiones: Aunque infrecuentes, los eventos de bacteriemia por S. gallolyticus/S. bovis tienen una elevada mortalidad hospitalaria, requieren con frecuencia procedimientos quirúrgicos y afectan a pacientes mayores con co-morbilidades. Cerca de dos tercios padecen de una patología colónica o hepatobiliar que actúa como foco primario y cerca de un cuarto presenta endocarditis infecciosa. La detección de este grupo bacteriano en los hemocultivos requiere una evaluación para establecer el origen de la bacteriemia y la presencia de complicaciones.

Gastroenteritis por Salmonella spp. en tres lactantes asociada a contacto con tortugas acuáticas / Salmonella spp. gastroenteritis associated to pet turtles in three infants

Non-typhoidal salmonellosis is an important cause of acute diarrhea in children. Generally they are acquired by consumption of contaminated food, but contact with reptiles is an increasing cause of this zoonoses. We describe three pediatric cases of gastroenteritis by Salmonella (Montevideo, Newport and Pomona), related to having turtles as pets. In two cases, the bacteria were isolated from the patient’s stools and the turtle’s droppings. The same genetic subtype by PFGE was obtained in both isolates. All the children recovered. Information and public health measures should be undertaken to control this zoonoses which affects young children.

Las infecciones por Salmonella no tíficas, son una importante causa de diarrea aguda en niños. Generalmente adquiridas por alimentos contaminados, el contacto con animales, especialmente reptiles, también es responsable de esta zoonosis. Describimos tres casos de lactantes con gastroenteritis por Salmonella (S. Montevideo, S. Newport y S. Pomona), relacionados a contacto con tortugas mascotas. En dos de los casos se aisló Salmonella en las deposiciones de los niños y de las tortugas. En todos hubo proximidad entre los niños y los acuarios y/o tortugas, siendo probable la contaminación en la preparación de alimentos. El estudio de clonalidad por electroforesis de campo pulsado demostró el mismo subtipo genético en el aislado correspondiente al paciente y en el procedente de la mascota, lo cual confirmó la fuente zoonótica de los casos. Esta zoonosis debe ser abordada por las autoridades de salud y las sociedades científicas, ya que representa un importante riesgo para la salud, especialmente de niños pequeños.

Artritis séptica en pacientes adultos en un hospital general de Chile / Septic arthritis in adult patients in a general hospital in Chile

Background: Septic arthritis is an infrequent condition of prolonged morbidity and there is no previous publications in Chile that allow orientate therapy. Aim: To characterize a group of adult patients with septic arthritis confirmed by culture. Material and Methods: Descriptive study of a case series. Results: From 2003 to august 2013, 24 patients with 25 events of septic arthritis were identified in a general hospital. Mean age was 68.3 years old (range 24-94). Predisposing conditions were harbored by 91.7%. Predominant clinical manifestations were pain (92%) and impaired joint movement (95.7%). Fever was present in 64%, hypotension in 28% of events, and C-reactive protein > 100 mg/L in 90.6%. Gram positive cocci were the most frequently isolated microorganisms (81.5%), predominating S. aureus (48.1%), and with 4 isolates methicillin resistant isolates (26.7%). Resistant isolates trend to be associated with previous surgery (p = 0.055) and all cases caused by non-fermentative Gram negative bacilli had recent hospitalization or surgery, a feature that did not reach a significant difference. Nine events were associated to bacteremia (36%). Outcome analysis indicated 32% of events with full recovery, 28% with a favorable evolution, 20% with therapy failure and 16.7% patients that died. A total of 24% of the series remained with significant sequels. Conclusions: Septic arthritis is an infrequent disease that affects in most cases patients with predisposing conditions. Associated symptoms include pain and impaired joint movement, sometimes fever, hypotension, positive blood cultures and frequently a C-reactive protein > 100 mg/L. Predominant agents are Gram positive cocci, specially S. aureus, including methicillin resistant isolates. Case-fatality ratio, treatment failure and sequels are important.

Antecedentes: Los cuadros de artritis séptica son esporádicos pero de elevada morbilidad y no hay publicaciones en Chile que permitan orientar el tratamiento de ellos. Objetivos: Caracterizar un grupo de pacientes con cuadros de artritis séptica confirmados microbiológicamente. Pacientes y Métodos: Serie de casos. Resultados: Un total de 24 pacientes con 25 eventos de artritis séptica fue identificado entre el 2003 y agosto de 2013. La edad promedio fue de 68,3 años (24-94) y 91,7% tuvo condiciones que predisponen. Las manifestaciones clínicas dominantes fueron dolor (92%) e impotencia funcional (95,7%), 64% presentó fiebre y 28% tuvo hipotensión arterial. Un 90,6% tuvo PCR > 100 mg/L. Las cocáceas grampositivas fueron los microorganismos más frecuentes (81,5%), predominando Staphylococcus aureus (48,1%) y cuatro cepas estafilocóccicas presentaron resistencia a cloxacilina (26,7%). Las cepas resistentes tendieron a estar asociadas a pacientes con cirugía articular previa (p: 0,055) y todos los casos asociados a bacilos gramnegativos no fermentadores tenían antecedentes de hospitalización reciente o cirugía articular previa. Nueve eventos (36%) se asociaron a bacteriemia. Un 32% de los pacientes tuvo curación, 28% un curso favorable, 20% fracaso y 16,7% falleció. Un 24% quedó con secuelas. Conclusiones: Los cuadros de artritis séptica son infrecuentes, afectan en su mayor parte a pacientes con factores que predisponen, se presentan con dolor e impotencia funcional, a veces fiebre, hipotensión arterial o bacteriemia y generalmente con PCR > 100 mg/L. Se asocian a cocáceas grampositivas, especialmente S. aureus, incluyendo aislados resistentes a cloxacilina. La letalidad, fracaso del tratamiento y secuelas no son despreciables.

Bacteremic pneumococcal pneumonia: serotype distribution, antimicrobial susceptibility, severity scores, risk factors, and mortality in a single center in Chile

AIMS: Bacteremic pneumococcal pneumonia (BPP) is a severe condition. To evaluate seasonal distribution, mortality, serotype frequencies, antimicrobial susceptibility, and different severity scores among patients with BPP. PATIENTS AND METHODS: Patients were identified by laboratory data and restricted to adulthood. Standard methods were used for serotyping and antimicrobial susceptibility. Risk factors were analyzed by univariate and multivariate methods. Severity scores (APACHE II, CURB-65 and CAP PIRO) were compared using ROC curves. RESULTS: Sixty events of community-acquired BPP occurred between 2005 and 2010. A seasonal pattern was detected. Mean age was 72.1 years old (81.4% >60 years). All had a predisposing factor. Previous influenza (3.3%) or pneumococcal immunization (1.7%) was infrequent. Admission to critical units was required by 51.7%. Twenty-two serotypes were identified among 59 strains. Only one strain had intermediate resistance to penicillin (1.7%). In-hospital mortality reached 33.3%. Multivariate analysis identified a CAP PIRO score>3 (OR 29.7; IC95 4.7-187), age >65 years (OR 42.1; IC95 2.2-796), and a platelet count<100,000/μL (OR 10.9; IC95 1.2-96) as significant independent factors associated with death. ROC curve analysis did not reveal statistical differences between the three severity scores to predict death (AUC 0.77-0.90). The prognostic yield for all of them was limited (Positive Likelihood Ratio: 1.5-3.8). CONCLUSIONS: BPP had a high case-fatality rate in this group of adult patients with no association to resistant isolates, and a low immunization record. Three independent factors were related to death and the prognostic yield of different severity scores was low. .

Infecciones por Listeria monocytogenes, una experiencia de dos décadas: A two decade experience / Infections by Listeria monocytogenes

Background: Listeria monocytogenes infections have been poorly characterized in Chile. ^4im: To evaluate clinical manifestations and risk factors associated to a fatal outcome in a series of patients. Methods: retrospective analysis of cases from 1991 to 2012. Results: Twenty three cases were identified, including 2 diagnosed after prolonged hospitalization (8.7%) with an average age of 68.4 years (range 44-90). Known predisposing factors were age > 65 years (60.9%), diabetes mellitus (40.9%), and immunosuppression (27.3%). Most cases presented after 2003 (70%). No cases associated with neonates, pregnancy or HIV infections were recorded. Patients presented with central nervous system (CNS) infection (39%), including 8 cases of meningitis and one of rhomboencephalitis; bacteremia (43.5%), including one case with endocarditis; abscesses (8.7%); and other infections (spontaneous bacterial peritonitis and pneumonia; 8.7%). Risky food consumption was found in 80% of those asked about it. Predominant clinical manifestations were fever (90.9%), and confusion (63.6%). CNS infections were associated to headache (OR 21, p < 0.05), nausea and vomiting (OR 50, p < 0.01). Only 45.5% received initial appropriate empirical therapy and 36.4% a synergistic combination. Eight patients died (34.8%), this outcome was associated to bacteremia (OR 8.25; IC95 1.2-59 p < 0.05). Conclusions: L. monocytogenes infections appear to be increasing in Chile, causing infections in different sites, attacking vulnerable patients, and have a high case-fatality ratio, especially among those with bacteremia.

Introducción: Las infecciones por Listeria monocytogenes representan una zoonosis con escasa caracterización clínica en Chile. Objetivo: Analizar manifestaciones clínicas y factores de riesgo asociados a desenlace fatal. Pacientes yMétodos: Estudio retrospectivo de casos desde 1991 a 2012. Resultados: Se identificaron 23 casos, dos de ellos de aparición nosocomial (8,7%). La edad promedio fue 68,4 años (rango 44-90). El 70% de los casos ha ocurrido desde el año 2003. Los factores predisponentes más frecuentes fueron edad > 65 años (60,9%), diabetes mellitus (40,9%) e inmunosupresión (27,3%). No se encontraron casos asociados a embarazo, infección por VIH o neonatos. La presentación clínica correspondió a infección del SNC (39%,) con ocho casos de meningitis y uno de romboencefalitis (5%); bacteriemias (43,5%) con un caso de endocarditis infecciosa; abscesos (8,7%) y un caso de neumonía y de peritonitis bacteriana espontánea (8,7%). El consumo de alimentos de riesgo fue buscado en cinco pacientes y confirmado en cuatro (80%). Las manifestaciones clínicas más frecuentes fueron fiebre (90,9%) y compromiso de conciencia (63,6%). La presencia de cefalea (OR 21 p < 0,05), o náuseas y/o vómitos (OR 50 p < 0,01) se asociaron en forma significativa a infección del SNC. Sólo 45,5% recibió una terapia antimicrobiana empírica inicial adecuada y 36,4% un esquema sinérgico. Ocho pacientes fallecieron (34,8%), desenlace que estuvo asociado a bacteriemia (OR 8,25; IC95 1,2-59 p < 0,05). Conclusiones: Las infecciones por L. monocytogenes parecen estar aumentando lentamente en Chile, producen infecciones en diferentes parénquimas, afectan a pacientes vulnerables, y tienen una alta letalidad, especialmente en el subgrupo con bacteriemia.

Colangitis bacteriémica en adultos en un hospital general en Chile / Bacteremic colangitis in adults in a general hospital in Chile

Background: Some aspects of bacteremic cholangitis are unknown in Chile. Aim: To gather more information on clinical, microbiological aspects as well as risk factors for ICU admission, recurrence and antimicrobial resistance. Material and Methods: A retrospective research was performed using medical records of adult patients in a general hospital. Results: Between 2006-2012, 22 patients with 29 bacteremic events were identified. Previous cholangitis events were reported by 27.3%, 45.5% had recent admissions and, 50% had used antimicrobial compounds. Coledocholithiasis was the most common cause of obstruction (45.5%) followed by cancer (36.4%). One third developed shock (31%), the only factor associated with ICU admission (OR 30, p < 0.05). In 24 of the 29 bacteremic events, the biliary tract was intervened (82.8%) and in 80.8% during the first 72 hours. Gram negative bacilli were predominant (> 80%) and some infrequent agents such as Staphylococcus warneri, Shewanella spp. and, Aeromonas spp. were observed. Among enteric gram negative bacilli, 29.2% presented fluoroquinolone resistance and, 26.1% resistance to third generation cephalosporins, both associated with previous endoscopic retrograde cholangiography (OR 35 and 16.5, respectively p < 0.05). A favorable response was observed in 93.1% of bacte-remic events but in 31.8% of patients cholangitis recurred with or without bacteremia. Recurrence was associated to recent admission (OR 16.5, p = 0.01) and in all cases occurred before 81 days. In-hospital mortality was 9.1% (n = 2), but in only one case associated to sepsis. Average length of stay (LOS) was 17.8 days. Conclusions: Early intervention of the biliary tract allows a favorable response in patients affected by bacteremic cholangitis, but this condition use intensive care resources, had a prolonged LOS, a recurrent pattern, and is associated with several bacterial species, some of them resistant.

Introducción: La información sobre los cuadros de colangitis aguda bacteriémica es fragmentaria en Chile. Objetivo: Analizar las características clínicas, evolución, microbiología y factores de riesgo asociados a ingreso a UCI, recurrencia y resistencia antimicrobiana. Pacientes y Métodos: Estudio retrospectivo descriptivo con adultos atendidos entre el 2006 y el 2012 en un hospital general. Resultados: Se identificaron 22 pacientes con 29 episodios de bacteriemia. Un 27,3% tenía historia previa de colangitis aguda, 45,5% de hospitalizaciones en los últimos tres meses y 50% recibió previamente antimicrobianos. La coledocolitiasis fue la causa más frecuente de obstrucción (45,5%) y las neoplasias ocuparon el segundo lugar (36,4%). El 31% desarrolló shock hemodinámico y fue el factor determinante para ingresar a la UCI (OR 30, p < 0,01) En 24 de los 29 eventos de colangitis bacteriémica se efectuaron intervenciones sobre la vía biliar (VB) o complicaciones asociadas (82,8%), las que se realizaron predominantemente en las primeras 72 h de hospitalización (80,8%). Las especies bacterianas mayoritarias fueron bacilos gramnegativos entéricos o no fermentadores (> 80% del total) y se observaron agentes inusuales como Staphylococcus warneri, Shewanella spp y Aeromonas spp. Entre los bacilos gramnegativos entéricos, 29,2% presentó resistencia a fluoroquinolonas y 26,1 % a cefalosporinas de tercera generación, fenómenos asociados al antecedente de colangiografía endoscópica retrógrada (OR 35 y 16,5 respectivamente, p < 0,05). El 93,1% de los eventos de bacteriemia tuvo una respuesta favorable pero 31,8% de los pacientes presentó recu-rrencia de colangitis, con o sin bacteriemia, un hecho asociado a hospitalización reciente (OR 16,5, p = 0,01) y que se dio en todos los casos antes de 81 días. Dos pacientes con cáncer fallecieron en la misma hospitalización (9,1%), aunque uno solo de ellos en forma atribuible a la infección. La estadía hospitalaria promedio fue de 17,8 días. Conclusiones: Con la intervención precoz sobre la VB, los cuadros de colangitis bacteriémica han logrado una baja letalidad pero usan recursos intensivos, tienen una estadía prolongada, un patrón recurrente, pueden estar asociados a cáncer y a una diversidad de agentes bacterianos, algunos de ellos resistentes.

Prevalencia de agentes enteropatógenos en síndrome diarreico agudo en niños hospitalizados y ambulatorios / Prevalence of enteropathogen in agents in acute diarrhea syndrome in impatient and out patient children

Para conocer importancia relativa de agentes enteropatógenos bacterianos y virales en niños con diarrea aguda que necesitan atención médica de nivel primario o secundario, se efectuó un estudio etiológico durante 2 períodos de verano. Primer período, verano 1983, 102 pacientes que cumplían con definición pre establecida de diarrea aguda (58 de hospital, 44 de consultorio) y 66. controles; segundo período, verano 86 se estudiaron 161 pacientes con diarrea (80 hospitalizados, 81 ambulatorios) y 71 controles pareados por edad. En el grupo con diatte los principales agentes detectados fueron E. coli enteropatógeno (ECEO) (37%), E. coli enterotoxiogénico (ECET) (21%), rotavirus (16%) shigella (12%). En el grupo control se aislaron ECEP, ECET, campylobacter y rotavirus; la frecuencia de ECEP, shigella y rotavirus fue significativamente inferior. En los pacientes hospitalizados por diarrea, con especto a los ambulatorios la prevalencia de ECEP y rotavirus en hospitalizados fue significativamente superior. Hubo mayor tendencia al aislamiento más frecuente de campylobacter en los pacientes ambulatorios